Лекции по биоинформатике: Анализ экспрессии. Демонстрация.

Слайды лекции: (pdf)

Тема

Данные экспрессии генов являются одними из важнейших объектов исследования современной биоинформатики. Цель данного курса — рассказать о данных экспрессии и основных методах анализа таких данных.

Некоторые аспекты темы я постараюсь проиллюстрировать практическими примерами на R. При желании и должном умении быстро печатать и следить за лектором и клавиатурой одновременно, приведенные примеры можно будет повторить "вживую". Прошу заметить, что это не обязательно — примеры с лекции будут выложены здесь для желающих повторить их самостоятельно, — но если вы все равно планируете сидеть с открытым лаптопом то лучше уж открывайте его по делу :).

Для выполнения демонстраций необходимо поставить себе систему R и несколько пакетов к ней. Лучше сделать это заранее, а то в лекционном зале на всех может не хватить интернета.

Подготовка

Часть I: Мыс Технологий

Часть II: а.о. Многомерного Анализа

Часть III: земля Смысла

Часть IV: республика Нуклеотидов

Заключение: Предсказывающие модели